지니너스

SpaceInsight Spatial Transcriptomics Service

암 정복의 힌트, 공간전사체 안에서 찾다.

공간전사체학(Spatial Transcriptomics)은 조직 샘플에서 유전자의 발현 정도를 해당 위치에 따라 한
눈에 볼 수 있는 획기적인 유전체 프로파일링 방법입니다.

원하는 부위에서 20,000~30,000여개 유전자의 발현량을 정량화할 수 있기 때문에 이를 활용하여
세포 활성도를 분석할 수 있으며, 알려지지 않은 세포간의 상호작용 (cell-cell interaction)을
발견하는데 적용이 가능하고 새로운 특성을 가진 세포 타입을 발견하는데 응용할 수 있습니다.

Visium(CytAssist)
Visium HD
Xeinum

Visium (CytAssist)

Visium은 조직에서 유전자의 발현정도를 위치에 따라 한 눈에 볼 수 있는 획기적인 유체 프로파일링 기술입니다.
Whole Transcriptome을 Sub-cellular 단위의 해상도로 빈 공간 없이 확인하여 새로운 세포 및 바이오마커를 discovery하고,
Spatial Analysis에 대한 insight를 제공합니다.

국내 최다 Visium 분석 서비스 수행 & 국내 최초 Visium 서비스 도입

지니너스는 국내 최초로 10X Genomics 사의 Visium 서비스를 도입하고 CSP(Certified Service
Provider)를 취득하여, 국내에서 가장 많은 검체를 다루고 있습니다.
여러 종류의 검체를 다루면서 쌓아온 노하우로 최상의 서비스를 제공 드리겠습니다.

Service Info

Service Info
Library method	Size	Sample type	Probe	Turnaround time
10X Genomics CytAssist	- 6.5mm x 6.5mm - 11mm x 11mm	Fresh Frozen, FFPE, PFA-Fixed, Frozen, TMA	- Human : ~18,000 genes - Mouse : ~19,000 genes	6~8 Weeks

※ Sequencing Reads 수는 협의 후 조정 가능합니다.

Workflow

Visium CytAssist

Sample QC
(RNA check, H&E staining)

분석 영역 확정
ROI (Region of Interest) 선정

Visium CytAssist
(Transcriptomic probe transfer)

Library
Construction

Sequencing

Data Analysis

Visium

Sample QC
(RNA check, H&E staining)

분석 영역 확정
ROI (Region of Interest) 선정

Visium
(Tissue permeabilization)

Library
Construction

Sequencing

Data Analysis

Feature

Basic Analysis

SpaceRanger
(Data Manufacture)

Seurat
(Statistical Analysis)

Machine Learning

Advanced Analysis (심화분석)

※ 해당 서비스는 상담 후 가능합니다.

Sample Quality Control

Cell Type Annotation

Trajectory Analysis

DEG Analysis

Pathway Analysis

Cell to Cell Intraction

Gene Corralation

Publications

Read publications and explore how researchers use Spatial Transcriptomics to accelerate novel discoveries.

> View Spatial Transcriptomics Publications

Know where the battlefield is

서비스 문의하기

Visium HD (CytAssist)

Visium HD는 조직에서 유전자의 발현정도를 위치에 따라 한 눈에 볼 수 있는 획기적인 유전체 프로파일링 기술입니다.
Whole Transcriptome을 Sub-cellular 단위의 해상도로 빈 공간 없이 확인하여 새로운 세포 및 바이오마커를 discovery하고, Spatial Analysis에 대한 insight를 제공합니다.

국내 최다 Visium 분석 서비스 수행 & 국내 최초 Visium 서비스 도입

Service Info

Service Info
Method	Size	Sample type	Probe	Turnaround time
10X Genomics CytAssist	6.5mm x 6.5mm	FFPE, Fresh Frozen, Fixed Frozen	- Human : ~18,000 genes - Mouse : ~19,000 genes	6~8 Weeks

※ Sequencing Reads 수는 협의 후 조정 가능합니다.

Workflow

Sample QC
(RNA check, H&E staining)

분석 영역 확정
ROI (Region of Interest) 선정

Visium CytAssist
(Transcriptomic probe transfer )

Library
Construction

Sequencing

Data Analysis

Feature

Basic Analysis

SpaceRanger
(Data Manufacture)

Seurat
(Statistical Analysis)

Machine Learning

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Xenium In Situ

Xenium In situ는 subcellular resolution으로 target gene 에 대한 spatial profiling이 가능한 차세대 spatial transcriptomics 플랫폼입니다. 수 백여개의 RNA target에 대한 세포내 매핑을 가능하게 하여 높은 민감도(sensitivity)와 특이도(Specificity)를
가진 고품질 데이터를 생성하여 세포 구조와 기능에 대한 새로운 insight를 제공합니다.

국내 최초 Xenium 서비스 도입 & 국내 유일 자체 Panel 구축

지니너스는 국내 최초로 10X Genomics 사의 Visium 서비스를 도입하고 최초로 XSP(Xeni-
um Service Provider)를 취득하여, 국내에서 가장 많은 검체를 다루고 있습니다.
여러 종류의 검체를 다루면서 쌓아온 노하우로 최상의 서비스를 제공 드리겠습니다.