다양한 분석 지원 | 핵심 기술 보유 | 전문 인재 보유 | 다년간의 경험
지니너스는 삼성서울병원 삼성유전체연구소에서 오랜 기간 숙련된 인력과 기술을 바탕으로 Human
외 다양한 생물의 DNA, RNA를 이용하여 다양한 유전체 정보를 분석해오고 있습니다.
지니너스의 High Quality NGS Service를 경험해 보시기 바랍니다.
Whole Genome Sequencing(WGS) 서비스는 인트론을 포함한 전체 유전체 영역을 한 번에 읽고, 분석 가능합니다. 기능적
요소와 관련된 유전적 변이인 Single Nucleotide Polymorphisms(SNPs), Insertions/Deletions(InDel)에 대한 종합적인
정보를 확인할 수 있습니다.
| Library Kit | gDNA size > 15,000bp | Tivist Library Preparation Reagent Kit, EF |
|---|---|---|
| gDNA size < 15,000bp | Tivist Library Preparation Reagent Kit, MF | |
| cfDNA | Tivist Library Preparation Kit, MF | |
| NGS Run Format | NovaSep 6000, NextSeq 550 | |
| Depth / Data output | 30X | 60X |
| 120G | 240G | |
| Turn Around Time |
~QC : 2 Weeks ~QC ~ Data 생산: 4 Weeks |
|
실험부터 분석까지 원스톱 솔루션을 제공드립니다.
Sample QC
(Tapestation, etc)
Library
Construction
Sequencing
Data Analysis
Cost Efficiently & Quality Guaranteed
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전체 유전체의 1%(30MB)에 불과하지만, 생물학적으로 매우 중요한 protein coding 영역인 Exon 부위를 선택적으로 분석할 수
있습니다. Exon 영역만 선택적으로 분석할 수 있기에, Single Nucleotide Variants(SNVs), Insertions/Deletions(InDel)을
빠르고 효율적으로 식별할 수 있는 장점이 있습니다.
| Library Kit | gDNA size > 15,000bp | Tivist Library Preparation Reagent Kit, EF | ||
|---|---|---|---|---|
| gDNA size < 15,000bp | Tivist Library Preparation Reagent Kit, MF | |||
| cfDNA | Tivist Library Preparation Kit, MF | |||
| NGS Run Format | NovaSep 6000, NextSeq 550 | |||
| Depth / Data output | 50X | 100X | 200X | 300X |
| 6G | 12G | 24G | 36G | |
| Turn Around Time |
~QC : 2 Weeks ~QC ~ Data 생산: 4 Weeks |
|||
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Total RNA Sequencing은 random primer를 활용하여 단백질 인코딩 RNA(Poly-A+RNA)와 non-coding RNA 전사체의
발현정보까지도 확인할 수 있습니다. Ribosomal RNA를 제거하여 다른 RNA에 대한 개선된 분석 결과를 확인할 수 있습니다.
| Library Kit | Illumina Library Standard Total RNA prep, Ligation with Ribo-Zero Plus |
|---|---|
| NGS Run Format | NovaSeq 6000 |
| Depth / Data output | 12G |
| Turn Around Time | ~QC : 2 Weeks ~QC ~ Data 생산: 4 Weeks |
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Messenger RNA(mRNA) sequencing은 polyadenylated(poly(A)) 혹은 coding region enrichment 방법을 활용하여
분석하며, 샘플 간의 유전자 발현 값의 자이(Expression Profiling)를 확인할 수 있습니다
- Stranded 방식: Poly(A) Capture방식을 사용하며, antisense transcription, enhances transcription이 포함되기에,
조금 더 넓은 범위의 gene expression을 확인할 수 있습니다
- Enrichment 방식: Exome Probe를 사용하여 NCBI hg19 reference genome을 통해 98% 상당의 Refseq exome cover
age로 데이터 확인이 가능합니다.
| Library Kit | Stranded | Illumina Stranded mRNA Prep, Ligation |
|---|---|---|
| Enrichment | Illumina RNA Prep with Enrichment, (L) Tag mentation | |
| NGS Run Format | NovaSeq 6000 | |
| Depth / Data output | 6G | |
| Turn Around Time | ~QC : 2 Weeks ~QC ~ Data 생산: 4 Weeks |
|
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